Игра Dr. Mario является разновидностью Тетриса, а не Супер Марио: игроку нужно победить вирусов трёх цветов, которые находятся в банке. Доктор Марио хочет вылечить «пациента» и забрасывает в ёмкость разноцветные пилюли.  Каждая пилюля состоит из двух половинок разного цвета (всего 6 цветовых комбинаций). Вращая пилюли необходимо составить ряд из 3 половинок такого же цвета как и вирус, только тогда вирус будет обезврежен и место которое он занимал освободится. Для прохождения этапа необходимо убить всех микробов.