Один из основных злодеев, противостоящих спасателям, кот Толстопуз совершил побег из тюрьмы и планирует выкрасть предмет, известный как Urn of the Pharaoh. Чтобы спасатели не смогли расстроить его планы, Толстопуз предпринимает серию отвлекающих действий, первым из которых становится бомба с часовым механизмом, оставленная его подручными в кафе. Чип, Дейл и вся команда отправляются обезвреживать бомбу и попутно пытаются помешать Толстопузу на его преступном поприще.
Вторая часть игры о бурундуках-спасателях отличается чётким сюжетом, многочисленными диалогами персонажей, разнообразными боссами уровней, которых следует ликвидировать с использованием уникальной тактики для каждого, и возможностью нахождения секретных мест с соревнованиями при игре вдвоём.
Боссы представлены как известными по сериалу врагами спасателей, так и разработанными специально для игры злодеями, которые встают на пути главных героев по ходу развития сюжета. Финальным боссом является робот-подобие кота Толстопуза
Вторая часть претерпела изменения:
Новая, улучшенная анимация персонажей и уровней.
Ящики теперь можно бросать и по диагонали.
Появилась возможность делать «супер-бросок» ящика и использовать своего напарника в качестве оружия. Если взять ящик (напарника) на руки и пройти некоторое время вперёд, не выполняя больше никаких действий, то ящик (напарник) будет мигать и, если его бросить в этот момент, то он будет сбивать всех врагов на своём пути.
В сражениях с некоторыми боссами появилась возможность использовать предметы, отличные от обычных ящиков (или красного шара, обычно выдававшегося героям для схватки с боссом в первой части игры).
Появились враги, не убиваемые ударом предмета, а теряющие сознание. Оглушённого противника после этого можно использовать как оружие.
После прохождения уровня подсчитывается количество собранных значков R/R («Rescue Ranger»). За каждые пятьдесят значков игрок награждается медалью (В режиме два игрока, за 30 значков получаешь медаль). За три медали игрок получает дополнительное сердечко (составляющая жизни), за пять медалей — ещё одно (при подсчёте очков пять сердечек отображаются как одно большое сердце). Таким образом игрок получил чёткую мотивацию для сбора значков и проверки всех встречающихся ящиков.